广州市第一人民医院消化内科为国家临床重点专科、广东省医学重点专科、广东省临床重点专科和广州市医学重点专科。南沙医院消化内科始建于2008年，已在南沙深耕10余年，2016年3月消化内科病区成立，现有医师11人，其中主任医师职称4人、副主任医师2人、主治医师3人、医师2人，全部研究生学历，其中博导1人，硕导2人，博士学位3人，在读博士1人，硕士7人。
经过多年的努力建设，科室现有由消化专科病房、专科门诊、消化内镜中心、胃肠动力室和消化实验室五大部分组成。消化病房开放床位24张，消化内镜中心面积700平方米，配备奥林巴斯高清放大内镜系统、超声内镜系统、以色列Given胶囊内镜系统、GE放射性C臂、ERBE消化内镜工作站、美顿微量射频消融仪、13碳/14碳呼气检测仪、高分辨食管与肛门直肠测压仪（HRM）、24小时食管PH-阻抗监测、身体成分检测仪、肝硬度弹性成像（Fibro scan）等设备。
消化内科常规开展幽门螺杆菌（HP）检测和分离培养鉴定工作，开展HP药敏试验，现已积累3000多株HP耐药菌株的抗菌药耐药谱，是全国幽门螺杆菌规范化诊治门诊。科室在消化性溃疡、功能性胃肠病、胃食管反流病、危急性消化道出血、慢性肝病及肝硬化失代偿期、消化系肿瘤、炎症性肠病、急性胰腺炎、胆总管结石和化脓性胆管炎等疾病诊治方面有着丰富经验，形成了幽门螺杆菌、消化道早癌和胆胰疾病诊治等三个亚专科的发展方向。2025年科室进一步响应国家细胞治疗先行先试的政策，率先在南沙开展全国首例骨髓间充质干细胞治疗慢加急性肝衰竭的临床应用。
消化内镜诊疗是科室特色技术，常规开展普通胃肠镜、无痛胃肠镜、胶囊内镜、内镜下消化道出血治疗、内镜下消化道异物取出术、内镜下消化道支架置入或取出术、内镜下息肉切除术。特别在内镜逆行胆胰管造影术（ERCP）、内镜黏膜下剥离术（ESD）、经口内镜肌切开术（POEM）、超声内镜（EUS）、经口胆胰子镜检查术、经内镜逆行阑尾炎治疗术（ERAT）、内镜下经皮胃造瘘术（PEG）等先进技术方面具有丰富的经验。
2018年科室获国家自然基金面上项目立项资助，三年来科室同时获省（厅）级科研立项4项，市级科研立项7项；发表多篇SCI论著。
