南沙医院感染科成立于2016年4月，主要开展各项传染病防治工作。现有医师5人，均为硕士学历，其中主任医师1人，副主任医师1人，主治医师3人；护理人员8人，副主任护士1人，主管护师6人，护师1人。
感染科主要业务包括肝病门诊、发热门诊、肠道门诊，年总门诊量在45000人次以上。其中肝病门诊主治各型病毒性肝炎、酒精性肝病、脂肪性肝炎、药物性肝炎、自身免疫性肝炎、肝吸虫病和肝硬化、肝癌，黄疸及不明原因肝功能异常等各种肝病，以慢性乙型和丙型肝炎抗病毒治疗、乙肝临床治愈、乙肝病毒携带孕妇母婴传播阻断管理、脂肪肝综合防治为特色。开展高灵敏HBV DNA、HCV RNA定量检测、HCV基因型等检查项目，拥有南沙区独一的FibroScan+CAP肝纤维化及脂肪变无创定量检测设备。
